1、技术分析（创新性、先进性、独占性）
全基因组选择能够提高育种的效率和遗传进度，在动植物育种领域具有重要的应用价值，是动植物育种的主要发展方向。小麦是山东省最重要的粮食作物，但是，全基因组选择技术在小麦育种实践中尚未得到应用，这主要受限于标记的数量量和预测模型两个方面的限制。为解决这一难题，我们利用简化基因组测序技术，对大量主要来自于我国小麦主产区的小麦优良品种（系）进行了测序，鉴定到432588个SNP位点。通过对重要的农艺性状、抗病性、抗冻性等的多年多点的表型鉴定和全基因组关联分析，筛选到约5万个显著关联的SNP位点。利用这些关联位点建立了全基因组选择模型，交叉验证结果显示模型预测的准确为80%左右，较之前人的研究提高了20~30%，在小麦全基因组选择育种中具有重要利用价值。而DNA芯片技术用于SNP分型，具有准确度高、价格低、操作简单等特点，方便育种家利用，是最适合大规模遗传研究和育种应用的SNP分型技术。因此，我们将这5万个SNP位点设计成SNP芯片。与国内外现有的小麦SNP芯片相比，我们鉴定的这些SNP位点具有明确的性状关联信息和预测模型，预测准确度高，可以直接应用于小麦全基因组选择育种，处于国际领先水平。我们已经将这些SNP位点申请了专利，具有独立的自主知识产权。
2、应用范围及目前应用状态
本发明主要应用于小麦全基因组选择育种，也可应用于QTL定位、标记开发、全基因组关联分析等遗传研究。目前与性状相关的所有的SNP位点以及探针序列信息都已经设计好，处于量产开发芯片阶段。
3、前景及经济社会效益分析
该小麦全基因组选择育种SNP芯片可在各小麦遗传育种研究单位和育种企业广泛推广和应用，将全面提升小麦分子育种的效率，促进小麦生物技术育种产业的现代化，促进我省现代农业产业体系建设及小麦产业提质增效，具有重要的经济和社会效益。
涉及专利：
一组与小麦抗寒性显著关联的SNP位点及其在遗传育种中的应用，申请号：202011542979.7